一、基本信息

王栋，男，中共党员，博士，副教授，硕士生导师

通讯地址：哈尔滨市香坊区和兴路26号东北林业大学逸夫实验楼325

E-mail: duke.wang@nefu.edu.cn

二、教育经历

2014.09-2021.07 华中农业大学 信息学院 生物信息专业 博士

三、工作经历

2021.08-2025.07 浙江大学 药学院 博士后、助理研究员

2025.12-至今 东北林业大学 食品与健康学院 副教授

四、所在学科

药学一级学科（药物化学方向）

五、研究领域/方向

致力于计算机辅助药物分子设计方法和应用研究，采用分子模拟、人工智能等技术研究重要药物靶标的结构、功能及动态过程，并通过与化学/生物学实验的有机结合来加速药物分子的发现。具体方向包括：1.合成药物化学；2.人工智能与计算机辅助药物分子设计。

六、近五年科研项目

1. 国家自然科学基金青年科学基金项目（C类），2024-2026年，主持

2. 东北林业大学成栋优秀青年人才项目，2025.12-2030.01，主持

3. 齐鲁药业-浙江大学联合研发项目，2022-2023，参与

七、代表性学术论文（10篇）

1. Wang D., Jin J., Shi G., Bao J., Wang Z., Li S., Pan P., Li D., Kang Y.*, Hou T. J.*, ADMET Evaluation in Drug Discovery. 21. Application and Industrial Validation of Machine Learning Algorithms for Caco-2 Permeability Prediction. J Cheminform, 2025, 17(1), 3.

2. Su Y., Lok W. T., Zhang M. M., Gao J. M., He J. X., Chao N., Yuan H., Ouyang Y. F., Wang D.*, Huang Y.*, Wang H.*, Yang H.*, Discovery of Protein Arginine Methyltransferase 1 Inhibitor by Structure-Based Pharmacophore Modeling, Virtual Screening, Molecular Dynamics Simulations, and the Enhancement of Paclitaxel’s Antitumor Activity. Eur J Med Chem, 2025:118066.

3. Wang D., Wu Z., Shen C., Bao L., Luo H., Wang Z., Yao H., Kong D. X.*, Luo C.*, Hou T. J.*, Learning with uncertainty to accelerate the discovery of histone lysine-specific demethylase 1A (KDM1A/LSD1) inhibitors. Brief Bioinformatics, 2023, 24(1): bbac592.

4. Jin J., Wang D., Shi G., Bao J., Wang J., Zhang H., Pan P., Li D., Yao X., Liu H., Hou T. J.*, Kang Y.*, FFLOM: A Flow-Based Autoregressive Model for Fragment-to-Lead Optimization. J Med Chem, 2023, 66(15), 10808–10823.

5. Wang, D.; Chen, N. H.; Alex G. T.; Jin Y. T.; Wen C. C.; Kong, D. X.*, Accelerating the Identification of Subtype Selective Inhibitors via Three-Dimensional Biologically Relevant Spectrum (BRS-3D): The Monoamine Oxidase Subtypes as a Case Study. Bioorg Chem, 2020, 106, 104503

6. Wang, D.; Li, Z.; Liu, Y.; Chen, M.; Chen, N.; Zuo, Z.; Kong, D. X.*, Identification of novel monoamine oxidase selective inhibitors employing a hierarchical ligand-based virtual screening strategy. Future Med Chem, 2019, 11(8), 801-816.

7. Wang, D.; Hong, R. Y.; Guo, M.; Liu, Y.; Chen, N.; Li, X.; Kong, D. X.*, Novel C7-Substituted Coumarins as Selective Monoamine Oxidase Inhibitors: Discovery, Synthesis and Theoretical Simulation. Molecules, 2019, 24(21).

8. Shen C., Zhang X., Hsieh C.Y., Deng Y., Wang D., Xu L, Wu J, Li D, Kang Y.*, Hou T.*, Pan P.*., A generalized protein-ligand scoring framework with balanced scoring, docking, ranking and screening powers. Chem Sci, 2023, 14(30):8129-8146.

9. Wang M, Hsieh C Y, Wang J, Wang D., Wen G., Shen C., Yao X., Bing Z., Li H.*, Cao D.*, Hou T. J.*, RELATION: A deep generative model for structure-based de novo drug design. J Med Chem, 2022, 65(13), 9478-9492

10. Shen C., Zhang X., Deng Y., Gao J., Wang D., Xu L., Pan P.*, Hou T. J.*, Kang Y.*, Boosting protein–ligand binding pose prediction and virtual screening based on residue–atom distance likelihood potential and graph transformer. J Med Chem, 2022, 65(15): 10691-10706

八、专著与教材

九、获奖/专利

1. 发明专利(授权)，一种噻二唑并三嗪类化合物在制备单胺氧化酶抑制剂中的用途，ZL201810103226.2，孔德信；王栋；左之利；王雅琪

2. 发明专利(授权)，一种香豆素类化合物在制备单胺氧化酶抑制剂中的用途，ZL201810103341.X，孔德信；王栋；左之利；王雅琪

3. 发明专利(授权)，一种异吲哚-1,3-二酮类化合物在制备单胺氧化酶抑制剂中的用途，ZL201810102054.7，孔德信；王栋；左之利；王雅琪

4. 发明专利(授权)，一种1,3-苯并噁硫醇-2- 酮类化合物在制备单胺氧化酶抑制剂中的用途，ZL201810102771.X，孔德信；王栋；左之利；王雅琪

5. 发明专利(授权)，一种5H-噻唑并[3,2-a]嘧啶-5-酮类化合物在制备单胺氧化酶抑制剂中的用途，ZL202010713053.3，孔德信；王栋

热烈欢迎有化学、计算机背景，且对药物化学、人工智能、化学信息学和分子生物学感兴趣的本科生、研究生加入本课题组。